美國總統特朗普下決心對敘利亞阿薩德政權采取軍事行動被認為受到了總統國家安全事務助理約翰·博爾頓的影響。在美國國防部對特朗普宣稱的大規模攻擊存在慎重意見的背景下，博爾頓強烈鼓勵了特朗普
4月13日晚間，在白宮宣布打擊敘利亞的決定時，特朗普身邊有兩位高官的身影。一個是白宮發言人桑德斯，一個是博爾頓
4月9日剛剛走馬上任的博爾頓主張對阿薩德政權采取更加強硬的舉措。據稱，由于2017年4月對敘利亞實施的打擊沒有取得充分效果，因此博爾頓此次支持大規模摧毀重要基礎設施等的攻擊。
美國國防部長馬蒂斯等國防部官員則認為，大規模攻擊有可能把支持阿薩德政權的俄羅斯卷入，從而加劇混亂局面。也正因如此，此次軍事行動僅對有限的目標實施了打擊。
報道指出，盡管如此，博爾頓的存在感不容忽視。圍繞對敘利亞政策，他主張需要采取包括應對作為阿薩德政權后盾的俄羅斯和伊朗在內的“更大規模戰略”。
美國總統特朗普3月22日宣布，美國前常駐聯合國代表約翰·博爾頓將取代麥克馬斯特，出任總統國家安全事務助理。任命從4月9日起生效。
